فیلوژنی مولکولی سه گونه دنبلان کوهی از ایران براساس ژنوم ریبوزومی

نویسندگان

رضا مستوفی زاده قلمفرسا

صمد جمالی

ضیاءالدین بنی هاشمی

چکیده

نمونه هایی از سه گونه دنبلان کوهی از مناطق مختلف جغرافیایی ایران جمع آوری شد. منطقه its شامل ژنs 8/5 از rdna با استفاده از آغازگرهای عمومی its4 وits1  تکثیر و توالی یابی شد. توالی های به دست آمده با سایر آرایه های معتبرِ مستخرج از بانک ژن مقایسه شد. در میان 12 نمونه مطالعه شده، هفت جدایه با نمونه های terfezia claveryi گزارش شده توسط سایر محققان، مطابقت داشت. نمونه های t. claveryi ایرانی به طور میانگین 4/99% (با دامنه 7/98-100%) با یکدیگر تشابه داشتند، در حالی که میانگین تشابه کلیه t. claveryi های مورد مطالعه2/95% (با دامنه 2/87-100%) بود. چهار نمونه مطابق با trimania pinoyi، به صورت آرایه خواهری tirmania nivea خود را نشان دادند که از گونه اخیر تنها یک نمونه یافت شد. نمونه های t. pinoyi ایران دارای 9/99% میانگین تشابه (با دامنه 8/99-100%) در بین خود و 2/97% (با دامنه 1/93-100%) میانگین تشابه در بین کلیه توالی های مورد مقایسه بودند.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

فیلوژنی مولکولی جنس Eumeces Wiegmann, 1834 (خزندگان: سینسیده) در ایران، براساس DNA میتوکندریایی ژن 16S

Phylogenetic relationships among the Eumeces schneiderii princeps and Eumeces schneiderii pavimentatus investigated using 509 bp partial sequences of 16S mitochondrial gene. Analyses were done by maximum-likelihood (RAxML) criteria on 52 specimens from over 20 geographically distinct localities. Our molecular results proposed two well-supported major clades by their phylogenetic positions, gene...

متن کامل

بررسی فیلوژنی مولکولی جنس Linaria Mill. (Plantaginaceae) در ایران براساس توالی DNA کلروپلاستی

سابقه و هدف: جنس Linaria Mill. متعلق به خانواده Plantaginaceae از راسته Lamiales است. زیستگاه این جنس در نیمکره شمالی و در برخی نقاط ایران می باشد. هدف این تحقیق بررسی وضعیت تاکسونومی و یافتن روابط فیلوژنی این جنس در ایران می باشد. مواد و روش ها: مطالعات مولکولی مطابق با روش زیر انجام گرفت: 1- استخراج DNA کامل از برگ ها، 2- تکثیر و تعیین ترادف قطعه ناحیه rpl32-trnL از ژنوم کلروپلاستی،3- انجام...

متن کامل

آغازگرهای اختصاصی برای شناسایی و ردیابی سه گونه دنبلان کوهی غالب ایران با تأکید بر terfezia claveryi

چکیده- دنبلان­های کوهی، آسکوکارپ زیرزمینی برخی آسکومیست­های قارچ­ریشه­ای هستند که در زیست­بوم­های نیمه خشک یافت می­شوند برای شناسایی سه دنبلان کوهی عمده­ی ایرانی:  terfezia claveryi، tirmania pinoyi و tirmania nivea روشی مبتنی بر واکنش زنجیره­ای پلیمراز بر اساس توالی­­های جداکننده­ی نسخه­برداری شده­ی داخلی در دی­اِن­اِی ریبوزومی ابداع گردید. دو آغازگر اختصاصی برای terfezia claveryi، چهار آغازگر ا...

متن کامل

فیلوژنی مولکولی خانواده گل شیپوری بر اساس داده های ناحیه its ریبوزومی هسته

منطقه its از dna ریبوزومی هسته ای به طور گسترده برای استنباط روابط فیلوژنتیکی در گیاهان مورد استفاده قرار می گیرد. در مطالعه حاضر، توالی sti بیست و چهار نمونه از ایران در کنار سایر توالی های این جنس در بانک ژن از .araceae l در ایران از جنس های .arum l، .schott biarum و .blume) schott) eminium مشخص گردید. آنالیز فیلوژنتیکی با روش های بایسین و maximum parsimony انجام گرفت. تحلیل کلادیستی روابط فی...

متن کامل

جداسازی، خالص سازی و شناسایی سه گونه دیاتوم (bacillariophyceae) از تالاب گمیشان براساس آنالیز فیلوژنی و توصیف فراساختار دیواره سیلیسی

دیاتوم های اپیپلیک تالاب گمیشان (استان گلستان)، یکی از زیستگاه های با ارزش در حاشیه شرقی دریای خزر، در سال 1392 جداسازی، خالص سازی و سپس مورد شناسایی قرار گرفتند. بدین منظور، از روش های رقیق سازی سریالی و کشت خطی روی محیط کشت f/2 استفاده و کشت خالص تهیه شد. برای شناسایی جدایه ها، مطالعات ریزریخت شناسی روی لام های دایمی تهیه شده انجام گردید و همچنین تصاویر میکروسکوپی الکترونی نگاره مورد بررسی قر...

متن کامل

بررسی فیلوژنی مولکولی جنس linaria mill. (plantaginaceae) در ایران براساس توالی dna کلروپلاستی

سابقه و هدف: جنس linaria mill. متعلق به خانواده plantaginaceae از راسته lamiales است. زیستگاه این جنس در نیمکره شمالی و در برخی نقاط ایران می باشد. هدف این تحقیق بررسی وضعیت تاکسونومی و یافتن روابط فیلوژنی این جنس در ایران می باشد. مواد و روش ها: مطالعات مولکولی مطابق با روش زیر انجام گرفت: 1- استخراج dna کامل از برگ ها، 2- تکثیر و تعیین ترادف قطعه ناحیه rpl32-trnl از ژنوم کلروپلاستی،3- انجام آ...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
رستنیها

ناشر: مؤسسه تحقیقات گیاه پزشکی کشور

ISSN 1608-4306

دوره 11

شماره 2 2011

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023